Listages des séquences biologiques de brevets Dictionnaire de données

Cet identificateur numérique est suivi du nom du demandeur. Il peut s'agir d'une personne ou d'une entreprise.

Remarque : Si le nom du demandeur est écrit en caractères autres que ceux de l'alphabet latin, la valeur sera une traduction ou une translittération.

Cet identificateur numérique est suivi du titre de l'invention.

Cet identificateur numérique est suivi du numéro de référence du dossier physique de la demande.

Remarque : Cet identificateur numérique s'affiche si le listage des séquences a été fourni à tout moment avant l'attribution d'un numéro de demande.

Cet identificateur numérique est suivi du numéro de demande de brevet actuelle.

Remarque : Cet identificateur numérique s'affiche si le listage des séquences a été fourni après l'attribution d'un numéro de demande.

Cet identificateur numérique est suivi de la date de dépôt de la demande actuelle.

Remarque : Cet identificateur numérique s'affiche si le listage des séquences a été fourni après l'attribution d'un numéro de demande.

Cet identificateur numérique est suivi du numéro de la demande antérieure lorsqu'un listage des séquences est déposé relativement à une demande qui revendique la priorité d'une demande antérieure.

Cet identificateur numérique est suivi de la date de dépôt de la demande antérieure lorsqu'un listage des séquences est déposé relativement à une demande qui revendique la priorité d'une demande antérieure.

Cet identificateur numérique est suivi du nombre de séquences (<400>) trouvées dans le document.

Cet identificateur numérique est suivi du logiciel utilisé pour créer des listages de séquences à inclure dans les demandes de brevet.

Cet identificateur numérique est suivi du numéro d'identification de la séquence correspondant à la séquence suivante (<400>).

Cet identificateur numérique est suivi de la longueur de la séquence (c.-à-d. le nombre de paires de base ou d'acides aminés).

Cet identificateur numérique est suivi du type de molécule séquencée, soit ADN, soit ARN, soit PRT.

Remarque : Si une séquence de nucléotides contient à la fois des fragments d'ADN et d'ARN, la valeur qui suit cet identificateur numérique sera celle de l'ADN.

Cet identificateur numérique est suivi du nom de l'espèce ou du nom scientifique de la molécule séquencée. Cette valeur peut aussi être « Séquence artificielle » ou « Non connu ».

Cet identificateur numérique est toujours laissé en blanc, mais il est suivi d'autres identificateurs numériques qui comportent une description des points ayant une importance biologique dans la séquence.

Remarque : Cet identificateur numérique est utilisé lorsque « n », ou « Xaa », ou une base modifiée ou un acide aminé L modifié ou peu connu est utilisé dans la séquence ou si l'organisme (identificateur numérique <213>) est « Séquence artificielle » ou « Non connu ».

Cet identificateur numérique est suivi de la clé de caractérisation qui représente les points ayant une importance biologique dans la séquence. Les clés de caractérisation et leurs définitions se trouvent aux annexes E et F.

Remarque : Cet identificateur numérique est utilisé lorsque « n », ou « Xaa », ou une base modifiée ou un acide aminé L modifié ou peu connu est utilisé dans la séquence.

Cet identificateur numérique est suivi de l'emplacement des points ayant une importance biologique dans la séquence selon la longueur de la séquence.

Remarque : Cet identificateur numérique est utilisé lorsque « n », ou « Xaa », ou une base modifiée ou un acide aminé L modifié ou peu connu est utilisé dans la séquence.

Cet identificateur numérique est suivi de la description des points ayant une importance biologique dans la séquence.

Remarque : Cet identificateur numérique est utilisé lorsque « n », ou « Xaa », ou une base modifiée ou un acide aminé L modifié ou peu connu est utilisé dans la séquence ou si l'organisme (identificateur numérique <213>) est « Séquence artificielle » ou « Non connu ».

Cet identificateur numérique est toujours laissé en blanc, mais il est suivi des informations concernant la publication.

Cet identificateur numérique est suivi du nom de l'auteur ou des noms des auteurs de la publication dans le périodique où se trouve le listage des séquences.

Cet identificateur numérique est suivi du titre de la publication dans le périodique où se trouve le listage des séquences.

Cet identificateur numérique est suivi du titre du périodique dans lequel se trouve le listage des séquences.

Cet identificateur numérique est suivi du volume du périodique dans lequel se trouve le listage des séquences.

Cet identificateur numérique est suivi du numéro du périodique dans lequel se trouve le listage des séquences.

Cet identificateur numérique est suivi de la série de pages du périodique dans laquel se trouve le listage des séquences.

Cet identificateur numérique est suivi de la date de parution du périodique dans lequel le listage des séquences.

Numéro d'entrée attribué par la base de données, y compris nom de cette base de données.

Date d'entrée dans la base de données.

Numéro du document, uniquement pour les citations de brevets.

Date de dépôt du document, uniquement pour les citations de brevets.

Date de publication du document, uniquement pour les citations de brevets.

Numéros d'identification des séquences (SEQ ID NOS) mentionnés dans la publication citée.

et Ser Arg Asp Arg Phe Arg Ser Arg Gly Gly Gly Gly Gly Gly Phe

1 5 10 15

His Arg Arg Gly Gly Gly Gly Gly Arg Gly Gly Leu His Asp Phe Arg

20 25 30

Ser Pro Pro Pro Gly Met Gly Leu Asn Gln Asn Arg Gly Pro Met Gly

35 40 45

individu ou souche apparenté contenant des formes stables différentes d'un même gène, qui se distingue de la séquence présentée à cet emplacement (et possiblement à d'autres emplacements)

1) région d'ADN où se produit une régulation de la terminaison de la transcription qui contrôle l'expression de certains opérons bactériens; 2) segment de séquence situé entre le promoteur et le premier gène de structure, qui provoque une terminaison partielle de la transcription

région constante de la chaîne lourde et de la chaîne légère de l'immunoglobuline et des chaînes alpha, bêta et gamma du récepteur d'un lymphocyte T; comprend un ou plusieurs exons, selon la chaîne

séquence CAAT; partie d'une séquence conservée située environ 75 paires de bases en amont du site d'initiation des unités de transcription eucaryotes, qui peut jouer un rôle dans la fixation de l'ARN polymérase; consensus=GG (C ou T) CAATCT

séquence codante (« coding sequence »); séquence de nucléotides correspondant à celle des acides aminés dans une protéine (l'emplacement comprend le codon d'arrêt); contient la traduction conceptuelle des acides aminés

les déterminations indépendantes de la « même » séquence diffèrent sur ce site ou dans cette région

boucle de déplacement (« displacement loop »); région au sein de l'ADN mitochondrial où une petite partie d'ARN est appariée à un brin d'ADN, entraînant le déplacement du brin original d'ADN dans cette région; désigne aussi le déplacement d'une région d'ADN double brin sous l'effet d'un envahisseur simple brin dans la réaction catalysée par la protéine RecA

segment de diversité (« diversity segment ») de la chaîne lourde de l'immunoglobuline et de la chaîne bêta du récepteur d'un lymphocyte T

séquence en cis entraînant l'utilisation accrue de (certains) promoteurs eucaryotes et dont l'action s'exerce quelle que soit l'orientation et l'emplacement (en amont ou en aval) par rapport au promoteur

région du génome codant une partie de l'ARN messager épissé; peut contenir la région 5'UTR, tous les CDS et la région 3'UTR

séquence GC; région conservée riche en GC, située en amont du site d'initiation des unités de transcription eucaryotes, qui peut prendre la forme de copies multiples et se produire dans les deux sens; consensus=GGGCGG

région présentant un intérêt biologique, identifiée comme étant un gène et à laquelle un nom a été attribué

AND intercalaire; ADN éliminé par l'un des types de recombinaison

segment d'ADN qui est transcrit, puis éliminé par aboutement des séquences (exons) situées de part et d'autre

segment de jonction (« joining segment ») de la chaîne légère et de la chaîne lourde de l'immunoglobuline, ainsi que des chaînes alpha, bêta et gamma du récepteur d'un lymphocyte T

répétition terminale longue (« long terminal repeat »); séquence directement répétée aux deux extrémités d'une séquence définie, du type de celle que l'on trouve dans les rétrovirus

séquence codante d'un peptide mature ou d'une protéine mature; séquence codante du peptide ou de la protéine à l'état mature ou final, qui suit la modification post-traductionnelle; l'emplacement ne comprend pas le codon d'arrêt (contrairement au CDS correspondant)

site d'un acide nucléique fixant, par covalence ou non, un autre fragment de molécule, qui ne peut être décrit par aucune autre clé de fixation (primer_bind ou protein_bind)

séquence de caractérisation différente de celle qui est présentée dans l'entrée et ne pouvant pas être décrite par une autre clé de différence (conflict, unsure, old_sequence, mutation, variation, allele ou modified_base)

région présentant un intérêt biologique, qui ne peut pas être décrite par une autre clé de caractérisation; nouvelle caractéristique ou caractéristique rare

site de toute recombinaison généralisée, spécifique d'un site ou réplicative, où se produit la cassure et la réunion de l'ADN double brin et qui ne peut pas être décrite par une autre clé de recombinaison (iDNA ou virion) ou par un autre qualificateur de clé source (/insertion_seq, /transposon, /proviral)

tout transcrit ou produit de l'ARN qui ne peut pas être défini par une autre clé de l'ARN (prim_transcript, precursor_RNA, mRNA, 5'clip, 3'clip, 5'UTR, 3'UTR, exon, CDS, sig_peptide, transit_peptide, mat_peptide, intron, polyA_site, rRNA, tRNA, scRNA ou snRNA)

toute région contenant un signal qui commande ou modifie une fonction ou l'expression d'un gène, qui ne peut pas être décrite par une autre clé de signal (promoter, CAAT_signal, TATA_signal, – 35_signal, – 10_signal, GC_signal, RBS, polyA_signal, enhancer, attenuator, terminator ou rep_origin)

toute structure ou conformation secondaire ou tertiaire qui ne peut pas être décrite par une autre clé de structure (stem_loop et D-loop)

le nucléotide indiqué est un nucléotide modifié, qui doit être remplacé par la molécule indiquée (donnée dans la valeur qualificative mod_base)

ARN messager; comprend la région non traduite en 5' (5'UTR), les séquences codantes (CDS, exon) et la région non traduite en 3' (3'UTR)

la souche apparentée présente un changement brusque et transmissible dans la séquence, à cet emplacement

des nucléotides supplémentaires sont insérés entre des segments d'immunoglobuline réarrangés

la séquence présentée est la version modifiée d'une ancienne séquence à cet emplacement

site de reconnaissance indispensable à la coupure d'un transcrit par endonucléase, suivie d'une polyadénylation; consensus=AATAAA

site d'un transcrit auquel sont ajoutés des résidus d'adénine par polyadénylation post-transcriptionnelle

ARN précurseur, c'est-à-dire tout type d'ARN qui n'est pas encore mature; peut comprendre la région coupée en 5' (5'clip), la région non traduite en 5' (5'UTR), les séquences codantes (CDS, exon), les séquences intercalaires (intron), la région non traduite en 3' (3'UTR) et la région coupée en 3' (3'clip)

transcrit primaire (initial, non remanié); comprend la région coupée en 5' (5'clip), la région non traduite en 5' (5'UTR), les séquences codantes (CDS, exon), les séquences intercalaires (intron), la région non traduite en 3' (3'UTR) et la région coupée en 3' (3'clip)

site de fixation non covalent pour amorces dans l'initiation de la réplication, de la transcription ou de la transcription inverse; comprend les sites pour les éléments de synthèse, par exemple les amorces de l'amplification en chaîne par polymérase (PCR)

région d'une molécule d'ADN jouant un rôle dans la fixation de l'ARN polymérase en vue de l'initiation de la transcription

site de fixation non covalent des protéines sur un acide nucléique

site de fixation du ribosome (« ribosome binding site »)

région du génome contenant des unités de répétition

unité d'un élément de répétition

origine de la réplication; site de départ pour la duplication d'un acide nucléique en vue de l'obtention de deux copies identiques

ARN ribosomique mature; molécule d'ARN de la particule ribonucléoprotéique (ribosome) qui assemble les acides aminés en protéines

région de commutation (« switch region ») des chaînes lourdes de l'immunoglobuline; joue un rôle dans le réarrangement de la chaîne lourde de l'ADN, qui conduit à l'expression d'une classe d'immunoglobuline différente à partir du même lymphocyte B

nombreuses séquences répétées en tandem (identiques ou apparentées) d'une courte unité de répétition de base; nombre d'entre elles ont une composition de base ou une propriété différente de la moyenne du génome, qui leur permet d'être séparées du reste de l'ADN génomique (bande principale)

petit ARN cytoplasmique (« small cytoplasmic RNA »); l'une des nombreuses petites molécules d'ARN cytoplasmique présentes dans le cytoplasme et (parfois) dans le noyau d'un eucaryote

séquence codante d'un peptide-signal; séquence codante d'un N-terminal de protéine sécrétée; ce domaine joue un rôle dans l'intégration du polypeptide naissant dans la membrane; séquence leader

petit ARN nucléaire (« small nuclear RNA »); l'une des nombreuses petites espèces d'ARN confinées au noyau; plusieurs snRNA jouent un rôle dans l'excision-épissage ou dans d'autres réactions de maturation moléculaire de l'ARN

permet d'identifier la source biologique de l'intervalle de séquence indiqué; cette clé est obligatoire; chaque entrée doit comporter, au minimum, une clé source unique couvrant la séquence tout entière; il est possible d'utiliser plus d'une clé source par séquence

épingle à cheveux; région d'une double hélice formée par l'appariement de bases entre des séquences contiguës (inversées) complémentaires appartenant à un même brin d'ARN ou d'ADN

site de séquence étiqueté; séquence d'ADN courte et unique caractérisant un point de repère de la cartographie du génome et qui peut être détectée moyennant une amplification en chaîne par polymérase (PCR); la carte d'une région du génome peut être dressée par détermination de l'ordre d'une série de STS

séquence TATA; séquence de Goldberg-Hogness; heptamère conservé, riche en A et T, situé environ 25 paires de bases en amont du site d'initiation de chaque unité transcrite par l'ARN polymérase II des eucaryotes, qui peut jouer un rôle dans le positionnement de l'enzyme aux fins d'une initiation correcte; consensus=TATA(A ou T)A(A ou T)

séquence d'ADN située soit à l'extrémité du transcrit, soit à côté d'un promoteur qui conduit l'ARN polymérase à terminer la transcription; peut aussi être le site de fixation d'un répresseur

séquence codante d'un peptide-transit; séquence codante d'un N-terminal de protéine d'un organite codée par le noyau; ce domaine joue un rôle dans l'importation post-traductionnelle de la protéine dans l'organite

ARN de transfert mature; courte molécule d'ARN (75-85 bases) qui permet la traduction d'une séquence d'acides nucléiques en une séquence d'acides aminés

l'auteur n'est pas certain de l'exactitude de la séquence dans cette région

région variable de la chaîne légère et de la chaîne lourde de l'immunoglobuline et des chaînes alpha, bêta et gamma du récepteur d'un lymphocyte T; codes applicables à la portion variable du terminal amino; peut être composée des segments suivants : V_segments, D_segments, N_régions et J_segments

segment variable de la chaîne légère et de la chaîne lourde de l'immunoglobuline et des chaînes alpha, bêta et gamma du récepteur d'un lymphocyte T; codes applicables à la plus grande partie de la région variable (V_region) et aux quelques acides aminés du peptide leader qui subsistent

souche apparentée contenant des mutations stables du même gène (par exemple : RFLP, polymorphismes, etc.) qui diffèrent de la séquence présentée à cet emplacement (et éventuellement à d'autres emplacements)

région d'un transcrit précurseur située en position 3', qui est coupée durant la maturation moléculaire

région en position 3' à l'extrémité d'un transcrit mature (qui suit le codon de terminaison) qui n'est pas traduite en protéine

région en position 5' d'un transcrit précurseur qui est coupée durant la maturation moléculaire

région en position 5' située à l'extrémité d'un transcrit mature (avant le codon d'initiation) qui n'est pas traduite en protéine

séquence de pribnow; région conservée située à environ 10 paires de bases en amont du site d'initiation des unités de transcription bactériennes, qui peut jouer un rôle dans la fixation de l'ARN polymérase; consensus=TAtAaT

hexamère conservé situé à environ 35 paires de bases en amont du site d'initiation des unités de transcription bactériennes; consensus=TTGACa [ ] ou TGTTGACA [ ]